فتحت كلية الدراسات العليا بجامعة سونان كاليجاكا الإسلامية الحكومية بيوجياكرتا برنامج اـلماجستير  في قسم الدراسات الإسلامية الـمتعددة التخصصات مع تركيز على النحو التالي:

أ‌)       العمل الاجتماعي

ب‌)  علوم الـمكتبات والـمعلومات

ت‌)  التوجيه والإرشاد الإسلامي

ث‌) علوم اللغة العربية

ج‌)    تاريخ الثقافة الإسلامية

ح‌)    إسلام نوسانتارا

خ‌)    الإسلام والتنمية والسياسة العامة

د‌)      دراسات التواصل والـمجتمع الإسلامي

ذ‌)     هيرمنيوطيقا القرآن

ر‌)    سيكولوجيا التربية الإسلامية

ز‌)    الإسلام ودراسات جنسانية

س‌) دراسات الشرق الأوسط

ش‌) دراسات الإعاقة والتعليم الشامل

ص) دراسات الـمقاصد والتحليل الإستراتيجي