Visi
Menjadi program studi Agama dan Filsafat yang unggul dan terkemuka dalam pemaduan dan pengembangan studi keislaman, keagamaan dan kefilsafatan bagi kemanusiaan yang transendental.

Misi

• Mengembangkan pendidikan jenjang Magister dalam bidang pemikiran keislaman, keagamaan, keilmuan, dan kefilsafatan yang padu, aktual, pluralis, dan transformatif.
• Mengembangkan wawasan keislaman, keagamaan, keilmuan, dan kefilsafatan yang padu, aktual, dan inklusif.
• Meningkatkan penelitian dan kajian ilmiah tentang keislaman keagamaan, keilmuan, dan kefilsafatan dengan penguasaan metodologi yang kuat.
• Memberdayakan masyarakat menuju terbentuknya masyarakat yang berkeadaban dalam bingkai universalitas nilai-nilai Islam dan kebhinnekaan Indonesia.

Sasaran
Mendidik sarjana strata satu (S1) agar menjadi sarjana Magister (S2) yang cakap, profesional dan memiliki  keunggulan kompetitif dalam bidang studi keagamaan dan kefilsafatan, sehingga sangat sesuai bila ditempatkan dalam lingkup profesinya, yaitu sebagai tenaga dosen studi agama dan studi filsafat  pada program S1,  konsultan dan peneliti studi keagamaan dan kefilsafatan.
Sasaran lain dari program studi Agama dan Filsafat adalah mempersiapkan para lulusan Magister yang siap dan berkemampuan untuk melanjutkan studi ke jenjang Program Doktor (S3).

Tujuan
Melahirkan Magister yang ahli dalam pemikiran Islam yang padu dengan studi keagamaan, kefilsafatan, dan ilmu-ilmu sosial-humaniora dalam rangka transformasi sosial nilai-nilai kemanusiaan universal dan transendental yang berkeadaban

Konsentrasi
Program Studi Agama dan Filsafat menawarkan konsentrasi:

• Filsafat Islam (FI)
• Studi al-Qur’an dan Hadis (SQH)
• Studi Agama dan Resolusi Konflik (SARK)
• Ilmu Bahasa Arab (IBA)
• Sejarah dan Kebudayaan Islam (SKI)